W ciągu ostatnich 20. lat Pro Helvetia rozwinęła sieć przedstawicielstw zagranicznych; fundacja posiada biura w Warszawie, Kairze, Kapsztadzie i New Delhi.

Prowadzi również centrum kultury szwajcarskiej w Paryżu i współpracuje z instytucjami partnerskimi utrzymującymi podobne ośrodki w Rzymie i w Nowym Jorku.

Poza tym, na zlecenie Szwajcarskiej Agencji Rozwoju i Kooperacji (SDC), Pro Helvetia prowadzi działalność w krajach bałkańskich.

Zagraniczna praca fundacji jest koordynowana przez departament International Affairs stanowiący część Pro Helvetii Zurych.